COOPI è presente in Uganda dal 2000 ed ha in questi anni implementato sia progetti di sviluppo che di emergenza. Proprio nel settore delle emergenze, COOPI ha realizzato interventi in diversi Distretti (Bundibugyo, Kasese, Nebbi, Soroti, Pader, Apac, Lira e Kitgum) supportando i rifugiati e gli sfollati (IDP).
In Uganda, COOPI si è impegnata nel miglioramento delle condizioni di vita delle popolazioni delle aree colpite dal ventennale conflitto fra il Governo Ugandese e i ribelli dell'LRA. L’attenzione di COOPI si è rivolta in particolare all’approvvigionamento idrico e alla promozione di migliori condizioni igieniche nei campi di IDP. Nel corso degli anni COOPI si è concentrata nel settore acqua e igiene, nell’ambito del quale si è occupata, per esempio, della costruzione di nuovi pozzi, della riparazione di pozzi non funzionanti e dell’installazione di sistemi di pompaggio e distribuzione acqua alimentati ad energia solare.



COOPI si è anche interessata al fenomeno della rivoluzione urbana manifestatasi attraverso un rapido sviluppo della città di Kampala ed ai problemi ad esso legati, tra cui la crescita smisurata delle aree informali, i cosiddetti “slums”.
Dal 2005 COOPI è intervenuta nel settore della Salute con progetti di varia natura finalizzati alla prevenzione e al miglioramento delle condizioni di salute di ex-bambini soldato e di donne vittime di violenze, mentre nel 2009 ha avviato un progetto di supporto alle attività agricole nel Pader, razionalizzando la distribuzione di semi nell’area.